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分析美國沙門菌型大數據

發布時間：

2020-12-27

沙門菌是20世紀最重要、導致食物中毒的病原體之一。公共衛生在過去數十年開始關注食物中毒之前，沙門菌存在至少已有100年。

在1880年之前，人類多認為食物中毒由腐敗食物產生化學物質導致，而在1900年后，人類不斷糾正這些錯誤觀點，認為胃腸道的腹瀉可能與食物等原材料有關，證據來自1880年后食物中毒病例多有食用豬肉、牛肉加工食品和牛奶及相關制品等的經歷。

隨著沙門菌（屬）的證實和大量血清型被甄別、命名，使全球的微生物學家、流行病學家和公共衛生管理者們找到令人激動的探索人類疾病的合作理由。

進入21世紀，伴隨各領域科學家對沙門菌的種型和結構研究不斷深入，人們對沙門菌的認識也逐漸完善，但依然有許多不解之謎留給相關專業學者，而對于公共衛生領域來說，意義在于根據各國、各地區有代表性研究來發現并闡述沙門菌及其眾多血清型給人群健康和社會經濟發展帶來程度不一的影響，避免陷入疾病負擔的高風險中。中國近代首位睜眼看世界者—魏源（1794–1857年）提出“師夷長技以制夷”對民國時期大批優秀的青年俊杰留學歐美學習先進的工業化知識和技術的拓展行動產生影響深遠。

1947年，中國首個沙門菌“取經人”—公派赴法的江蘇鹽城籍學子陳廷祚執意從巴斯德研究所前往仰慕已久的丹麥考夫曼國際沙門菌中心，師從弗里茨·考夫曼教授學習沙門菌診斷血清制備等免疫學鑒定分型技術。他學成歸國后在成都生物制品研究所（成都所）自主研制成新中國首套沙門菌血清分型診斷試劑盒，填補了國內空白。

2009年，陳老繼任者、時任成都所沙門菌與志賀菌專業實驗室主任的朱超教授與上海市疾病預防控制中心的許學斌主任合編出版《沙門菌屬血清型診斷》，滿足了國內公共衛生、臨床檢驗、獸醫養殖、農產品檢驗檢疫、等相關專業實驗室的需求。

上海自2005年作為中國首批加入全球沙門菌監測網絡（WHO/GSS）的成員，通過能力建設和跨部門合作完成沙門菌（血清型）在區域性生態疾病和食物鏈的基線調查，在國內外重要期刊發表相關研究論文，同時為與國際先進檢測技術和標準接軌，積極參與國際室間比對。

The External Quality Assurance System of the WHO Global Foodborne Infections Network（WHO-EQAS）歐洲室間比對，始于2000年，為WHO全球食源性感染網絡授權丹麥國家血清研究所與丹麥科技大學組織的每年一次的質控活動，滿足第三方網絡實驗室的監測質量評價需求。自2013年始，作者領銜區域性網絡實驗室參與并積極幫助國內其他省市縣（廣西、新疆、山西）公共衛生、臨床、出入境（海關）、質監等近50個專業實驗室參加年度EQAS考核，參加項目從最初的沙門菌，不斷擴展到志賀菌、彎曲菌、小腸結腸耶爾森菌、腸產志賀樣大腸埃希菌等多種食源性致病菌。在完善自我評價的同時，有效促進了國內同行與國際規則的適應與融合。基于能效結合的高質量人群沙門菌監測與質控訓練整合，逐漸完成趨向參比實驗室的基于沙門菌精準分型的標準化程序和多源化血清型數據庫建立。